【2025年厳選】在庫管理システムおすすめランキング比較！無料版の違いやメリットも解説

【比較表】在庫管理システムおすすめ10選

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在庫管理システムとは？基本的な考え方と役割

在庫管理システムとは「在庫管理を最適化するツール」

在庫管理システムとは、 商品の在庫数や保管場所、入出庫の流れをデジタルで一元管理できるツール です。

人手やExcelでは難しいリアルタイム管理や誤差のない在庫把握を、システムが自動でサポートします。

特に複数拠点での在庫管理や、頻繁な出荷がある業種では効果が大きく、ミスの削減や業務の効率化、安定供給の実現に直結します。

在庫管理システムと他管理方法の違い

在庫管理は、企業の利益や業務効率に直結する重要な業務です。

管理方法には 「紙」「Excel」「在庫管理システム（アプリ）」「販売管理システム」の4つ のタイプがあり、それぞれコスト・運用負荷・対応可能な業務範囲に差があります。

在庫管理の4原則を支える在庫管理システムの役割

在庫管理の4原則とは、 「在庫の所在がすぐわかる」「在庫の数量がすぐわかる」「先入先出ができる」「アクションのポイントがわかる」の4つ です。

これら4つの原則は、在庫の無駄や欠品を防ぐうえで欠かせない要素ですが、紙やExcelによる管理では実行が難しく、ミスや属人化の原因になりがちです。

在庫管理システムを活用することで、各原則に対応した管理が自動化され、より正確かつ効率的な在庫運用が実現します。

在庫管理ソフトウェア市場は世界的に拡大中

在庫管理ソフトの世界市場は、2024年時点で約231億ドル、2032年には約479億ドルに達すると予測されています。

POSや会計システム、ECサイトとの連携強化に加え、倉庫の自動化ニーズが拡大の主な要因 です。

特に中小企業でも在庫の可視化や作業効率の向上を目的に導入が進んでおり、業務効率化やキャッシュフロー改善への関心の高まりが市場成長を後押ししています。

参考：在庫管理ソフトウェア市場の動向|成長[2032]│Fortune Business Insights

在庫管理システムの種類

在庫管理システムの基本機能一覧

在庫管理システムのメリット・デメリット

在庫管理システムのメリット

在庫管理システムの 最大のメリットは、「リアルタイムで在庫を可視化できること」 です。

特に、型番やロット単位での管理が必要なメーカーや、委託倉庫を使っている事業者にとって、どこに・いくつ・いつ入出庫されたかを即座に把握できるのは大きな強みです。

人手では追いきれない細かな在庫の動きを、誤差なくシステムで記録できるため、棚卸や受発注の工数削減にも直結します。

在庫管理システムのデメリット

在庫管理システムの 最大のデメリットは、「自社に合わないシステムを選ぶと、かえって業務が複雑になること」 です。

例えば、商品ごとに色やサイズの種類が多く、季節によって売れ行きが変わる業種では、分析機能が弱いシステムだと結局エクセルとの併用が必要になり、手間が増えてしまいます。

また、画面の操作が分かりづらいシステムの場合、入力ミスや抜け漏れが多くなり、かえって在庫数が合わなくなるケースも少なくありません。

在庫管理システムの導入が向いている企業

在庫管理システムは、 「在庫数が月ごとに変動しやすい業種」や「複数拠点・多品種少量の取り扱いがある企業」に向いています 。

例えば、EC運営企業やD2Cブランド、BtoB商社などでは、色やサイズ、型番違いなど細かい商品バリエーションが増えるほど、手作業での管理には限界があります。

特に、受注と出荷のタイムラグがある業態では、リアルタイムの在庫引き当て機能があるだけで、欠品・二重出荷などのヒューマンエラーを大幅に削減可能です。

在庫管理システムの選び方

在庫管理システムを選ぶ際は、 単に機能の多さだけでなく「自社の現場で実際に使いやすいか」を重視することが重要 です。

例えばバーコードやハンディ端末の連携があっても、現場作業員が直感的に操作できない場合、入力ミスや遅延が増える可能性があります。

また、複数拠点の在庫を一元管理する場合は、拠点間のリアルタイム連携の仕組みが整っているかも必ず確認しましょう。

こうした現場の細かな運用課題に対応できるかどうかが、システム導入の成功の鍵となります。

在庫管理システムの料金相場

在庫管理システムの形態別料金相場

在庫管理システムの料金は、導入形態や機能の違いによって大きく変わります。

無料プランから大企業向けの高機能システムまで幅広く展開されているため、 価格だけでなく自社の業務規模や管理精度の必要度に合わせて選ぶことが重要 です。
 

※フリーミアム…基本的な機能は無料で提供し、より高度な機能やサービスを利用したい場合に有料プランにアップグレードする仕組みのこと

在庫管理システム、無料と有料で何が違う？

無料の在庫管理システムは、初めて導入する企業や在庫量が少ない場合に便利ですが、次のような制限があります。

一方、 有料システムは業務の複雑さや規模に合わせた細かなカスタマイズが可能 です。特に以下のポイントで差が出ます。

無料は「まず試したい」段階向け、有料は「業務効率化やミス削減の投資」として選択される傾向が強いです。

将来的な業務拡大を見据え、導入時にサポート体制や拡張性を慎重に検討しましょう。

【解説】在庫管理システムおすすめ10選

Square（POSレジ連携／アプリ）

「Square」の在庫管理機能は、 無料で利用できる点が最大の魅力 です。

POSレジと連携し、販売と同時に在庫が自動で減るため、数え間違いの心配がありません。

商品が少なくなると自動でメール通知が届き、在庫切れによる販売機会の損失も防止できます。

スマホからいつでも在庫の確認・編集ができるため、忙しい店舗経営者に特におすすめ

売上・在庫・EC連携まで！万能POSレジ

Square POSレジの詳細はこちら

ロジザードZERO（EC・物流／クラウド型）

「ロジザードZERO」は、 クラウド型倉庫管理システム（WMS）として20年以上の実績を誇る信頼性の高いシステム です。

EC事業者をはじめ、卸売業や製造業にも対応可能で、多様な業種に適応します。

最短1か月でのスピード導入が可能で、ECカートや受注管理システムとの連携機能も豊富。365日対応のサポート体制も安心です。

zaico（小規模事業／クラウド型）

「zaico」は、 小規模事業者向けのクラウド型在庫管理システム です。

バーコードを読み取るだけで入出庫処理ができるため、在庫管理の手間を大幅に削減可能です。

IoT重量計やRFIDとの連携による「数えない在庫管理」など、最新技術を活用した業務の自動化にも対応しています。

はじめて在庫管理をシステム化したい企業におすすめ

楽楽販売（中堅企業／クラウド型）

「楽楽販売」は、 販売管理分野で累計5,000社以上の導入実績を持つクラウド型システム です。

見積書や受発注データの転記ミスを防ぎ、請求処理の精度を高めるなど、販売業務のミスと手間を同時に解消できます。

業務フローに合わせた柔軟なカスタマイズが可能で、電子帳簿保存法にも対応しており、法令順守が求められる企業にも安心です。

アラジンオフィス（製造業特化／パッケージ）

「アラジンオフィス」は、 販売・在庫・生産管理を一元化した製造業向けパッケージ型システム です。

アパレル・食品・医療・鉄鋼・ねじ業界など、多様な業種に特化した導入実績が5,000社以上あり、業態に応じた柔軟なカスタマイズに対応します。

クラウドにも対応しており、テレワークや在宅勤務の現場でも活用できます。

ClovernetERPクラウド（クラウド型ERP）

「Clovernet ERPクラウド」は、 販売・仕入・在庫・会計・経費・給与・勤怠までを一元管理できるクラウド型ERP です。

各業務間のデータ連携を自動化し、手作業の削減と業務効率化を実現できます。

月額8,250円（税込）から利用でき、初期費用も0円とコスト面でも導入しやすい仕様です。

法改正への自動対応も備えており、長期的な運用にも適している

みえぞう（製造業向け／クラウド型）

「みえぞう」は 製造業に特化したクラウド型在庫管理システムで、生産・販売・在庫管理業務の簡略化と可視化を実現 します。

特に、階層無制限の部品構成表（BOM）機能は、必要な部品数を自動計算することで、リアルタイムで部品の不足を把握し、適切な発注が可能です。

月額3万2,780円（税込）から利用でき、無制限のユーザーアカウントも提供されるため、コスト削減にもつながります。

ネクストエンジン（EC特化／クラウド型）

「ネクストエンジン」は、 50以上のECモール・カートに対応している、EC事業者向けの一元管理ツール です。

複数店舗の受注・在庫・商品情報をまとめて管理できるため、売り越しの防止や人的リソースの削減に大きく貢献します。

売上拡大と同時に省力化を図りたい事業者にとって、非常に心強いシステムです。

flam（中小規模／クラウド型）

「flam」は、 中小規模事業者向けのクラウド型在庫管理システム です。

あらゆるデバイスに対応しており、オフィスや現場を問わず高速レスポンスでスムーズに操作できます。

場所や環境を選ばない柔軟な運用が可能で、業務のスピードアップに貢献します。

SASO（無料のオープンソースシステム）

「SASO」は、 無料で使えるオープンソースの在庫管理システム です。

「何が・どこに・いくつあるか」を明確にすることに特化したシンプルな機能構成が特徴です。

バーコードリーダーや棚番管理、棚番ラベルの印刷機能など、基本的な在庫管理に必要な要素を無料で備えています。

初期費用をかけずに在庫管理を始めたい方におすすめ

【タイプ別】在庫管理システムおすすめ一覧

無料で使える在庫管理システム

• Square：POSレジと連携して在庫を自動調整する
• zaico：最大200件まで無料で使えるクラウド型システムで、スマホ対応が特徴
• SASO：オープンソースで無料、ラベル印刷に対応する
• ロジクラ：初期費用が無料で、Shopifyと連携可能な在庫管理システム

パッケージ・買い切り型の在庫管理ソフト

• アラジンオフィス：製造業に特化したパッケージ型ソフトで、カスタマイズが可能
• 在庫らくだプロ：オンプレミス型の買い切りソフトで、低コストが特徴

小規模事業・個人向けの在庫管理システム

• Square：OSレジ連携とシンプルなUIで、小規模事業に適している
• zaico：クラウド型で直感的な操作が可能、スマホでのスキャンに対応する
• flam:：中小規模向けのクラウド型システムで、操作性重視におすすめ
• ネクストエンジン：EC特化のクラウド型システムで、小規模EC事業者に最適
• ロジクラ：EC連携とiPhoneでの検品が可能なシステム

高機能・中〜大規模向けの在庫管理システム

• ロジザードZERO：ECと物流に特化したクラウド型システムで、複数倉庫管理に対応
• 楽楽販売：中堅企業向けのクラウド型システムで、業務効率化を支援
• Clovernet ERPクラウド：クラウド型ERPで、複数拠点のリアルタイム管理が強み
• みえぞう：製造業向けのクラウド型システムで、在庫と生産管理を統合 
• アラジンオフィス：製造業に特化し、クラウド版も提供、5000社以上が導入済み
• タナヨミ：クラウド型でカスタマイズが可能、倉庫業務を効率化する

在庫管理システム活用のポイント・導入事例

在庫管理システム導入でよくある失敗

在庫管理システムを導入しても 「在庫のズレや誤差が完全に解消されない」と感じる企業は意外に多い です。

この現象は、システムだけが原因ではなく、現場の運用ルールや他システムとの連携不足も影響しています。

特に、販売時のPOSレジや経理の会計ソフトと連携できていない場合、実際の売上や返品情報が正確に反映されず、在庫データにズレが生じることがあります。

そのため、単独のシステムだけで完結するのではなく、周辺システムとの連携をしっかりと考慮することが、失敗回避の鍵です。

在庫がずれることで販売機会を逃したり、誤差で過剰発注が発生することに頭を悩ませている企業も少なくありません

在庫管理システムを最大限に活かすには？

在庫管理システムの 効果を最大限に引き出すには、POSレジや会計ソフトなど周辺システムとのシームレスな連携が不可欠 です。

例えば、POSと連動すれば、販売データがリアルタイムで在庫に反映され、過剰発注や欠品のリスクを減らせます。

また、会計ソフトと連携すれば、経費や売上との照合も自動化でき、スピーディーに経営判断を行うことが可能です。

このような連携を考慮したシステム選びと運用設計が、現場の負担軽減と在庫精度向上を実現します。

在庫管理システムの導入成功事例

• 参考：SAILFAST | Square POSレジ導入事例
• 参考：株式会社SODA│導入事例│

売上・在庫・EC連携まで！万能POSレジ

Square POSレジの詳細はこちら

まとめ

在庫管理システムは、単なる在庫の可視化にとどまらず、POSや会計ソフト、ECサイトとの連携により業務全体の最適化を実現できるツールです。

現場の運用に合わないシステムを選ぶと逆に非効率になるため、商品数や拠点数、操作性、拡張性を軸に選定することが成功の鍵となります。

導入後の効果を最大化するには、連携機能やサポート体制も含めた全体設計が重要です。システム単体でなく“業務全体”を見て選ぶ視点が求められます。